Resumen :

Un año después del final de Persona 4, Naoto es invitado a investigar las misteriosas desapariciones de dos estudiantes Yagakoro por un viejo amigo detective, Touko Aoi. Allí, se ha asociado con Sousei Kurogami, un detective mecánico y un polo opuesto a ella en términos de personalidad y metodología. En su primer encuentro, ella despierta a una nueva persona Amatsu Mikaboshi, que le permite amplificar la habilidad de Persona Sousei, Tsukuyomi. Junto con Sousei, descubre que el sito Midnight, un sitio anónimo donde el juicio se transmite a otros por cinco jueces que llevan el nombre de figuras de la mitología japonesa: Uzume, Sarutahiko, Omoikane, Tajikarao y Futotama.